Согласно определению Всемирной организации здравоохранения, дисбактериоз кишечника не является самостоятельной нозологией. Но актуальность данного патологического состояния в практике семейного врача, терапевта, гастроэнтеролога и других специалистов от этого не уменьшается. Нарушение соотношения полезных и патогенных микроорганизмов в кишке хоть и не является отдельным заболеванием, но может быть косвенным признаком имеющееся у человека сопутствующей патологии.

Дисбактериоз кишечника —  это количественное и качественное изменение бактериального содержимого дистального отдела ЖКТ —  желудочно-кишечного тракта (тонкого и толстого кишечника), которое сопровождается неспецифическими диспепсическими расстройствами и снижением иммунитета.

В организме человека существует тенденция к изменению количества и вида бактериальной флоры в разных отделах кишечника: в тонкой кишке преобладают стрептококки и стафилококки, лактобактерии, грамположительные аэробы в количестве 105, а в толстой кишке—  анаэробы (бифидобактерии и бактероиды). Важно отметить, что бактерии —  это не только возбудители инфекционных заболеваний. Ряд микроорганизмов, живущих в кишечнике, способствует нормальному пищеварению, обеспечивает местный, и в некоторой мере общий иммунитет, а также предупреждает колонизацию патогенных бактерий путем их «вытеснения».

Принципиальные отличия в значении бактерий в кишечнике для организма человека стали причиной создания следующей классификации:

• Облигатные бактерии —  полезные микроорганизмы, которые положительно влияют на процесс пищеварения, защищают кишечник от патогенной колонизации, активируют синтез витаминов. К ним относятся бифидо- и лактобактерии, кишечная палочка.
• Факультативные бактерии —  микроорганизмы, которые относятся к условно-патогенной флоре, то есть при определенных условиях увеличение их количества приводит к поражению ЖКТ. В норме число этих бактерий не превышает 0,6% от числа всех микроорганизмов.
• «Транзиторные» бактерии при нормальной микрофлоре кишечника обычно не выявляются.
• Патогенные бактерии —  микроорганизмы, появление которых в кишечнике приводит к тяжелым заболеваниям (сальмонеллезу, дизентерии и др.).

Существуют четкие показатели «бактериального состава» тонкого и толстого кишечника, которые определяют нормальную микрофлору. В случае отклонения от этих значений говорят о дисбактериозе.